研究lncRNA互作的新工具:简便易用的ChIRP试剂盒[新品推荐]

【字体: 时间:2017年12月18日 来源:生物通

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  长链非编码RNA(lncRNA)得到了科学界的广泛关注,不过在研究lncRNA与蛋白的相互作用时,现成可用的产品非常少。近日,默克公司推出了一款ChIRP试剂盒,让研究人员能够更轻松地鉴定和分析与lncRNA及其他RNA相互作用的染色质区域。

长链非编码RNA(lncRNA)得到了科学界的广泛关注,不过在研究lncRNA与蛋白的相互作用时,现成可用的产品非常少。近日,默克公司推出了一款ChIRP试剂盒,让研究人员能够更轻松地鉴定和分析与lncRNA及其他RNA相互作用的染色质区域。

ChIRP(Chromatin Isolation by RNA Purification)方法是斯坦福大学的研究人员在2011年首次介绍的。这种技术在lncRNA研究方面很有潜力,能够定位与染色质相关RNA发生相互作用的基因组位点。不过,实验方案比较复杂,需要来自不同供应商的多种试剂。因此,只有实验高手才有信心开展这种分析。

这款名为Magna ChIRP™ RNA Interactome Kit的一体化试剂盒简化了ChIRP的操作流程,让所有实验室都能进入这一领域。它提供了所有必需的缓冲液、酶和试剂以及阴性对照探针组,还有详细的实验方案。第一次动手的用户则可以选择EZ-Magna ChIRP™ kit,它还带有阳性对照探针组和检测引物,方便验证实验是否成功。

试剂盒利用even/odd多组探针设计,特异性地捕获和检测与RNA相互作用的DNA、RNA或蛋白,操作简便,灵敏度高,有助于研究人员发现新的分子机理和研究靶点。这种拆分的捕获探针也避免了非特异性的信号,有助于明确鉴定特异性的相互作用。

具体的实验流程如下。首先是交联和裂解细胞,超声波处理,再加入生物素化的捕获寡核苷酸,它们与互补的RNA序列结合。然后加入PureProteome™链霉亲和素磁珠,强力拉下与目标RNA结合的染色质区域。在洗涤后,分离DNA、RNA或蛋白组分进行进一步的分析。

默克生命科学的负责人Patrick Schneider表示:“近年来,非编码RNA已经逐渐成为热门的研究领域,因为研究人员发现DNA序列本身并不能决定细胞的遗传命运。目前已开展大量研究,以了解染色质相关RNA如何影响基因表达和表观遗传调控。Magna ChIRP™ RNA Interactome Kit为此提供了一种简便方法,让所有研究人员都能使用。”

欢迎索取Magna ChIRP RNA Interactome Kit的详细资料和报价

目前已发表的文献:

Long noncoding RNA GIHCG promotes hepatocellular carcinoma progression through epigenetically regulating miR-200b/a/429.
Sui, CJ; Zhou, YM; Shen, WF; Dai, BH; Lu, JJ; Zhang, MF; Yang, JM
J Mol Med (Berl)  1281-1296  2016

Long noncoding RNA glypican 3 (GPC3) antisense transcript 1 promotes hepatocellular carcinoma progression via epigenetically activating GPC3.
Zhu, XT; Yuan, JH; Zhu, TT; Li, YY; Cheng, XY
FEBS J  3739-3754  2016

Long Noncoding RNA lncCAMTA1 Promotes Proliferation and Cancer Stem Cell-Like Properties of Liver Cancer by Inhibiting CAMTA1.
Ding, LJ; Li, Y; Wang, SD; Wang, XS; Fang, F; Wang, WY; Lv, P; Zhao, DH; Wei, F; Qi, L
Int J Mol Sci  0  2016

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